凌云宗的内门与外门不同，每座峰的修炼都非常明确，内门的九座浮峰分四技五武，四技分别是掌管宗门内所有丹方，提供丹药的丹峰——炉香峰，给宗门供给符箓的御符峰，研究阵法的阵玄峰，以及给宗门炼制各种法器的灵铸峰，而五武又分一法一音一体两兵，分别是研习术法的紫云峰，通晓音律的逸音峰，锻炼体术的落日峰，修炼剑法的云霞峰，以及修炼刀法的苍云峰。
内门九大浮峰都设有相应的职位和机构，每座峰上最高职位为峰主，依次为峰长老，峰大师兄和峰大师姐，峰执事。内门不设食堂，但是每座峰都有一个特殊的修炼之地——灵泉圣地，按照规定，内门的弟子每一个月可免费进入修炼七天，如果想要继续使用则需要到峰上的内务堂分堂进行报备并缴纳10枚中品灵石。
凌云宗内设有四大机构统筹管理宗门内大小事宜，分别内务堂，内事堂，任务堂和执法堂，内务堂掌管宗门的经济来往，活动组织，对外社交等；内事堂相当于后勤部门，掌管着宗门内的修炼资源，负责分配和分发长老和弟子的俸禄，各种活动的奖励，以及一些生活物资；任务堂负责收集和发布宗门任务和悬赏任务，宗门任务就是宗门内长老发布的一些教习，打扫，采摘等的任务，而悬赏任务就是宗门外的一些狩猎妖兽，采集物资，除魔，调查等，然后根据任务的完成度进行奖励发放；执法堂顾名思义，就是一个负责维护宗门规矩和纪律的机构，执法堂的主要职责是对违反宗门门规的弟子进行抓捕、审讯和惩罚。
内门的弟子大多精修一门，所谓术业有专攻，因此内门的弟子不管是哪一门，单领出来都是外门无法相比的天骄。虽然内门弟子都是天资聪颖，修为高深的，但内门的弟子也有很多不足，其一，内门的弟子太过看重修为，因此大多数时间都在只专注自身的修炼，很少注重与外人交流，因此大多数人都自视甚高；其二，他们在层层保护下成长，修为没有到筑基后期大都不会出宗历练，这导致他们作战经验远不比外门弟子丰富，面对突发情况也不能应对自如；其三，内门弟子大多
内门九大浮峰都设有相应的职位和机构，每座峰上最高职位为峰主，依次为峰长老，峰大师兄和峰大师姐，峰执事。内门不设食堂，但是每座峰都有一个特殊的修炼之地——灵泉圣地，按照规定，内门的弟子每一个月可免费进入修炼七天，如果想要继续使用则需要到峰上的内务堂分堂进行报备并缴纳10枚中品灵石。
凌云宗内设有四大机构统筹管理宗门内大小事宜，分别内务堂，内事堂，任务堂和执法堂，内务堂掌管宗门的经济来往，活动组织，对外社交等；内事堂相当于后勤部门，掌管着宗门内的修炼资源，负责分配和分发长老和弟子的俸禄，各种活动的奖励，以及一些生活物资；任务堂负责收集和发布宗门任务和悬赏任务，宗门任务就是宗门内长老发布的一些教习，打扫，采摘等的任务，而悬赏任务就是宗门外的一些狩猎妖兽，采集物资，除魔，调查等，然后根据任务的完成度进行奖励发放；执法堂顾名思义，就是一个负责维护宗门规矩和纪律的机构，执法堂的主要职责是对违反宗门门规的弟子进行抓捕、审讯和惩罚。
内门的弟子大多精修一门，所谓术业有专攻，因此内门的弟子不管是哪一门，单领出来都是外门无法相比的天骄。虽然内门弟子都是天资聪颖，修为高深的，但内门的弟子也有很多不足，其一，内门的弟子太过看重修为，因此大多数时间都在只专注自身的修炼，很少注重与外人交流，因此大多数人都自视甚高；其二，他们在层层保护下成长，修为没有到筑基后期大都不会出宗历练，这导致他们作战经验远不比外门弟子丰富，面对突发情况也不能应对自如；其三，内门弟子大多